本校前身-國立高雄應用科技大學金門分部於86年7月1日設立，並成立二年制觀光事業科，積極培育觀光專業人才；於89年增設進修部觀光管理系夜二技，92年獨立設校為國立金門技術學院的第二年，二年制觀光事業科改制為四技觀光管理系、97年設立島嶼休閒資源發展研究所，99年系所合一為觀光管理學系（所）。